فتحاللهزاده تابحال مدیریت باشگاه فوتبال استقلال تهران را در سه برهه زمانی و به مدت بیش از ده سال عهده دار بوده است و توانسته دو بار به مقام قهرمانی در لیگ،چهار عنوان قهرمانی در جام حذفی و یک دوره به مقام نائب قهرمانی جام باشگاه های آسیا برسد.[نیازمند منبع]
وی توانسته در فصل نقل و انتقالات بازیکنانی همچون کرار جاسم و آندرانیک تیموریان را از باشگاه فوتبال تراکتورسازی تبریز ، سیدمهدی رحمتی ، خسرو حیدری و هاشم بیک زاده را از باشگاه سپاهان ، رسول خطیبی را از باشگاه فوتبال هامبورگ ، فرهاد مجیدی را از بهمن کرج ، آرش برهانی را از پاس تهران ، میلاد میداودی را از استقلال اهواز و جواد نکونام را از اوساسونا به این باشگاه آورد.